Apple hat nun das Software-Update 3.1.3 für den iPod touch und das iPhone veröffentlicht. Laut Beschreibung enthält die Aktualisierung Fehlerbehebungen sowie verschiedene weitere Verbesserungen, unter anderem: Verbesserte Genauigkeit der Batteriestatusanzeige beim iPhone 3GS, Behebung eines Problems, bei dem die Apps von Drittanbietern gelegentlich nicht starten; Behebung eines Fehlers, der das Abstürzen von Apps beim Benutzen der japanischen Kana-Tastatur verursacht.

Desweiteren werden verschiedene Sicherheitsprobleme behoben. Das Update ist sowohl mit allen iPhones wie auch mit allen iPod touch-Modellen kompatibel.